BASE_SPEC_FLAG
if ((input_args_p->flags & (BASE_SPEC_FLAG | NEXUS_FLAG)) ==
(BASE_SPEC_FLAG | NEXUS_FLAG)) {
if ((confirm) && (!(parsed_args->flags & BASE_SPEC_FLAG))) {
if (parsed_args->flags & BASE_SPEC_FLAG) {
if (*flags_arg & BASE_SPEC_FLAG) {
if (*flags_arg & BASE_SPEC_FLAG) {
*flags_arg |= BASE_SPEC_FLAG;